राष्ट्रपति चुरे-तराई मधेश संरक्षण क्षेत्र कार्यक्रमले निम्न उद्देश्यहरू पूरा गर्ने लक्ष्य राखेको छ:
चुरे क्षेत्रको प्राकृतिक स्रोत संरक्षण: भूमि, जल, वन र जैविक विविधताको संरक्षण गरी दिगो विकास सुनिश्चित गर्नु।
जलस्रोत संरक्षण र व्यवस्थापन: तराई क्षेत्रका जनताका लागि निरन्तर र भरपर्दो पानी आपूर्ति सुनिश्चित गर्नु।
प्राकृतिक विपद् न्यूनिकरण: बाढी, पहिरो, भूमिस्खलनजस्ता जलजन्य विपद्को जोखिम कम गर्नु।
समुदायमा सचेतना र सहभागिता वृद्धि: स्थानीय जनसमुदायसँग सहकार्य गरेर दिगो वन तथा जल स्रोत व्यवस्थापनमा सहयोग पुर्याउनु।
जैविक विविधता संरक्षण: चुरे क्षेत्रका बिरुवा, जनावर र अन्य जीवजन्तुको संरक्षण गर्नु।
जलवायु परिवर्तनसँग जुध्ने उपायहरू अपनाउनु: वातावरणीय असन्तुलनका कारण हुने समस्यालाई न्यूनिकरण गर्ने उपायहरू अवलम्बन गर्नु।